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2022-10

患者來源腫瘤類器官指導(dǎo)復(fù)發(fā)膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的個性化治療
發(fā)布時間:2022-10-13 10:30:32作者:精科醫(yī)學(xué) 來源:精科醫(yī)學(xué)




引文

膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(GBM)是人類神經(jīng)系統(tǒng)中最常見的原發(fā)惡性腫瘤,約占原發(fā)性腦腫瘤的15%。GBM也是人類最惡性的腫瘤之一,由于其侵襲能力和轉(zhuǎn)移能力很強,患者通常預(yù)后較差,中位生存期15個月,五年內(nèi)生存率僅5%,十年內(nèi)生存率為不足2.6%。針對不同患者個體化藥物治療,需要合適的臨床前GBM模型用于藥物篩選。有研究表明,患者來源的膠質(zhì)母細(xì)胞瘤類器官(PD-GBO)能夠保留體內(nèi)GBM的關(guān)鍵特征,可進(jìn)行候選藥物的功能分析,有望成為臨床前發(fā)現(xiàn)腫瘤潛在個體有效治療方案的方法。

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研究方法與結(jié)論




構(gòu)建不同患者來源的膠質(zhì)母細(xì)胞瘤類器官,驗證PD-GBO與患者體內(nèi)GBM的一致性,用PD-GBO對FDA批準(zhǔn)的41種藥物進(jìn)行藥篩,對原代腫瘤組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析用以分析個體藥物反應(yīng)和通路特征之間的相關(guān)性。結(jié)果表明,PD-GBO是一個有潛力的藥物篩選平臺,同時也證明在大致能夠滿足臨床需求的時間內(nèi),PD-GBO平臺可用于臨床前識別針對特定形態(tài)膠質(zhì)母細(xì)胞瘤特征的新藥。





研究結(jié)果




1

建立不同患者的膠質(zhì)母細(xì)胞瘤類器官




MA01-03為WHO Ⅳ級IDH野生型膠質(zhì)母細(xì)胞瘤;MA04為WHO Ⅳ級星形細(xì)胞瘤IDH突變體。

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圖1 不同患者M(jìn)RI




2

PD-GBO與體內(nèi)膠質(zhì)母細(xì)胞瘤高度一致

1. PD-GBO在培養(yǎng)中保持增值活力,且保留體內(nèi)膠質(zhì)母細(xì)胞瘤已知表達(dá)的特定標(biāo)記;

2. PD-GBO具有膠質(zhì)母細(xì)胞瘤形態(tài)學(xué)特征——包括GFAP和嵌套標(biāo)記腫瘤微管(TM)的存在(評估藥物反應(yīng)的模型中非常重要);

3.PD-GBO中TM標(biāo)記的存在與定位與體內(nèi)表達(dá)完全重疊;

4.PD-GBO中鈣信號的變化與腫瘤微管的功能相關(guān)。



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圖2 PD-GBO保留膠質(zhì)母細(xì)胞腫瘤組織的特征


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圖3 PD-GBO中TM網(wǎng)絡(luò)密度和細(xì)胞存活率的自動計算分析




3

PD-GBO藥篩為患者確定有效候選藥物




1.在用構(gòu)建的PD-GBO對41種FDA批準(zhǔn)的藥物進(jìn)行篩選之前,首先用AIVIA Software 9.8.1(DRVISION Technologies)實現(xiàn)深度學(xué)習(xí)切分,來量化PD-GBO表型藥物篩選所需的形態(tài)學(xué)特征;

2. 膠質(zhì)母細(xì)胞瘤樣本培養(yǎng)成腫瘤球后再將單細(xì)胞懸液在板上打印成PD-GBO,在24h后進(jìn)行6天藥物測試,可在手術(shù)后14-19天報告藥物篩查結(jié)果;

3. 針對不同患者的PD-GBO藥物反應(yīng),為不同的患者篩選出個體化治療有效的候選藥物,(MA01-依維莫司、克唑替尼、foretinib和達(dá)沙替尼;MA02-克唑替尼;MA03-阿法替尼和RXDX-101;MA04-無)。


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圖4 個性化藥物篩選




4

分析原代組織通路富集與

PD-GBO對藥物反應(yīng)的關(guān)系




1.對原代腫瘤組織進(jìn)行RNA測序,研究不同的KEGG通路的富集是否可以預(yù)測 PD-GBO對41種藥物的反應(yīng),尋找藥物反應(yīng)與個體特定KEGG通路富集的相關(guān)性;

2.個體間通路的差異,也反映了個體間的腫瘤異質(zhì)性;

3.不同的藥物反應(yīng)與KEGG通路富集呈現(xiàn)出不同的聚類關(guān)系,不同的藥物反應(yīng)也可能與不同的通路相關(guān),ERBB通路信號與藥物伊維莫司、達(dá)沙替尼和阿法替尼治療的反應(yīng)呈負(fù)相關(guān)。相對的,MAPK通路信號與藥物克唑替尼、達(dá)沙替尼和阿法替尼治療的反應(yīng)呈正相關(guān)。



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圖5 原代腫瘤中的通路富集與PD-GBO藥物反應(yīng)的相關(guān)性




評價:

一個合適的膠質(zhì)母細(xì)胞瘤模型能夠可靠地再現(xiàn)患者實際的腫瘤異質(zhì)性、細(xì)胞間通訊以及膠質(zhì)瘤細(xì)胞與腫瘤微環(huán)境(TME)的相互作用。PD-GBO在分子、結(jié)構(gòu)和功能層面保留了患者腫瘤基因組結(jié)構(gòu)、基因表達(dá)譜和細(xì)胞多樣性特征,且能夠作為藥篩平臺在初始培養(yǎng)的2周內(nèi)揭示潛在的個體化治療方案,更及時的輔助臨床治療。

雖然PD-GBO已成為了如今臨床和科研的可靠模型,但其也存在一定的缺陷,無法還原體內(nèi)膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的所有微環(huán)境,比如血管和浸潤免疫細(xì)胞,PD-GBO沒有考慮血腦屏障——這是腦癌化療的主要障礙之一和治療失敗的常見原因。伴隨技術(shù)發(fā)展,PD-GBO將不斷變得更加完善,從而更好地服務(wù)患者。




精科亮點

精科醫(yī)學(xué)作為國內(nèi)類器官技術(shù)轉(zhuǎn)化先行者,我們在類器官培養(yǎng)上積累了豐富的經(jīng)驗,涵蓋了乳腺癌、肺癌、胃腸癌、肝癌、膀胱癌、前列腺癌、腎癌、甲狀腺癌、卵巢癌、宮頸癌、骨肉瘤以及腦腫瘤等多種實體腫瘤。其中基于活檢組織的微量建模培養(yǎng)成功率極高,同時可以實現(xiàn)穿刺標(biāo)本的“一樣兩檢”(類器官藥敏+NGS)。精科擁有自主研發(fā)的類器官培養(yǎng)技術(shù),能夠有效地延長樣本保護(hù)期,擴大地域覆蓋面。此外我們還和多家醫(yī)院和科研機構(gòu)開展科研與臨床合作。目前我們已經(jīng)在類器官建模方法、類器官鑒定、藥物敏感性檢測方法、類器官共培養(yǎng)等多個重要技術(shù)上實現(xiàn)突破,并已建立相關(guān)的實驗室標(biāo)準(zhǔn)。




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